Родился 26 ноября 1974 года в семье служащих.В 1992 годуокончил Екатеринбургскую школу № 110. В этом же году он поступил в Уральскую государственную юридическую академию. Обучался по специальности «Юриспруденция». Затем получил второе высшее образование в Тюменском государственном университете (специальность – «Биология»). Работал доцентом в Уральской государственной сельхозакадемии.В 2011 году защитил кандидатскую диссертацию в Тюменской государственной сельскохозяйственной академии. Обучался там по специальности «Экология и природные ресурсы». Присвоена ученая степень:кандидат биологических наук (Экология). Кроме того, прошел обучение по президентской программе подготовки управленческих кадров. Специализировался на стратегическом менеджменте. Также прошел дополнительное обучение по программе «Стратегия управления предприятием», имеет6-летний стаж юридической работы.
В 2003 годуИлья Бондарев возглавил Уральский НИИ водных биоресурсов и аквакультуры.
В июле 2009 годауказом губернатора Свердловской области он был назначен на пост первого заместителя министра природных ресурсов области. В конце того же года заступил на должностьминистра сельского хозяйства и продовольствия Свердловской области. Двумя годами позже стал заместителемпредседателя правительства Свердловской области, сохранив при этом должность министра.
В апреле 2012 годаИлья Эдуардович Бондаревработал только в качестве заместителя председателя правительства Свердловской области, с контролем 5 органов исполнительной власти: министерства сельского хозяйства и продовольствия, министерства природных ресурсов,департамента лесного хозяйства, департамента по охране, контролю и регулированию использования животного мира, департамента ветеринарии.
На этом посту, среди прочего, участвовал в заседаниях правительства Свердловской области, координировал разработку и реализацию программ по развитию субъектов малого и среднего предпринимательства в сельскохозяйственной сфере, принимал непосредственное участие в работе комиссий, занимающихся вопросами использования земель сельхозназначения, в работе чрезвычайной противоэпизоотической комиссии и других. Участвовал в разработке проектов нормативных правовых актов по вопросам, относящихся к его компетенции.
С 13.03.2013 г.по настоящее время – председатель НП «Союз животноводов Урала».
С 12.03.2014 по 30.04.2016 гг.– член общественного совета Министерства сельского хозяйства Российской Федерации.
С 2013 г.– был генеральным директором ООО «УГМК-Агро».
Гендиректор компании Агро-Актив.
С сентября 2023 года является вице-спикером думы Екатеринбурга.