Помощник главы Роскосмоса, экс-начальник Центра подготовки космонавтов имени Ю. А. Гагарина
Родился 4 марта 1965 года в городе Балхаш Джезказганской области, Казахская ССР.
В Актюбинске окончил среднюю школу № 22, а также Школу юных летчиков имени В. И. Пацаева. Поступил в Оренбургское высшее военное авиационное училище летчиков (ВВАУЛ) имени И. С. Полбина на специальность «Командная тактическая морской ракетоносной авиации». В 1998 году окончил Военно-воздушную инженерную академию (ВВИА) имени Н. Е. Жуковского по специальности «Испытания летательных аппаратов и их систем», получил квалификацию «летчик-инженер-исследователь».
С 1986 по 1995 годы служил в частях морской авиации Балтийского флота, а затем – в частях ПВО. В 1998 году по окончании Военно-воздушной инженерной академии имени Н. Е. Жуковского был зачислен в отряд космонавтов.
Решением Высшей аттестационной комиссии от 24 сентября 2010 года ему присвоена ученая степень доктор технических наук. В этот же день полковник Юрий Лончаков был утвержден в должности Командира отряда Центра подготовки космонавтов имени Ю. А. Гагарина.
Приказом начальника ФГБУ НИИ ЦПК летчик-космонавт РФ, полковник Юрий Валентинович Лончаков освобожден от должности инструктора-космонавта-испытателя 2-го класса и уволен из ЦПК с 13 сентября 2013 г. по собственному желанию в связи с переходом на новое место работы. Через месяц (при новом руководстве) вернулся в ЦПК и стал помощником главы Роскосмоса. 7 апреля 2014 года приказом руководителя Роскосмоса назначен начальником Центра подготовки космонавтов имени Ю. А. Гагарина. Покинул этот пост в 2017 году.