Трижды избирался депутатом Государственной Думы Российской Федерации. В 1999 году по 19-му Саранскому одномандатному избирательному округу, в 2003 году – по 20-му Саранскому избирательному округу, в 2007 году – по списку партии «Единая Россия». С 2000 по 2002 гг. — заместитель председателя Комитета по делам Федерации и региональной политике Государственной Думы. С 2002 по 2007 гг. — председатель Комитета по делам Федерации и региональной политике Государственной Думы. В это время комитет занимается вопросами совершенствования бюджетного федерализма, правовым обеспечением межбюджетных отношений между Федеральными органами государственной власти и органами государственной власти субъектов Российской Федерации.
27 января 2006 года решением ВАК В.И. Гришину присуждена Учёная степень доктора экономических наук. 8 сентября 2008 года В.И. Гришин избран ректором Российской экономической академии им. Г.В. Плеханова. Покинул пост в 2020 году. В.И. Гришин является почетным доктором наук Российской экономической академии им. Г.В. Плеханова. В.И. Гришин защитил диссертации: на соискание степени кандидата экономических наук по теме «Организационно-экономические основы реформирования экономики субъекта Российской Федерации» и диссертацию на соискание ученой степени доктора экономических наук «Региональная экономическая политика в условиях реформирования экономики Российской федерации».