Родился 10 марта 1963 года в г. Москве. В 1985 г. окончил Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова.
С 1990 по 1992 гг. – ведущий, главный специалист Управления уровня жизни и демографии Министерства труда и социальных вопросов СССР.
С марта 1992 г. по сентябрь 1992 г. – главный специалист, начальник отдела уровня жизни Независимого исследовательского центра по поддержке реформ в социально-трудовой сфере.
В 1992–1996 гг. – заместитель начальника Управления политики занятости и народонаселения Министерства труда Российской Федерации.
В 1996–1997 гг. – заместитель начальника департамента политики занятости и народонаселения Министерства труда и социального развития Российской Федерации.
С 1997 г. по 2004 г. – заместитель начальника департамента комплексного анализа, прогнозирования и мониторинга Министерства труда и социального развития РФ.
Март – май 2004 г. – руководитель Департамента политики доходов, оплаты труда и социального страхования Министерства труда и социального развития РФ.
В 2004–2007 гг. – директор Департамента трудовых отношений и государственной гражданской службы Министерства здравоохранения и социального развития РФ.
С 18 декабря 2007 г. назначен заместителем Министра здравоохранения и социального развития РФ.
В августе 2012 года стал проректором Академии труда и социальных отношений.
21 августа 2020 года на заседании Общественного совета Федеральной службы аккредитации заместителем председателя советаизбран проректор по стратегии и работе с органами власти Финансового университета.
В настоящий моментАлександр Сафонов проректор по стратегии и работе с органами власти федерального государственного образовательного бюджетного учреждения высшего образования "Финансовый университет при Правительстве Российской Федерации".